O corpo discente do curso de ciências Biológicas, em articulação com o Departamento de Ciências Biológicas e demais instâncias superiores da Universidade, idealizou um Encontro voltado especialmente ao ensino Fundamental e Médio, Encobio Jr., que possuía como proposta a extensão dos conhecimentos científicos adquiridos pelos estudantes de graduação. O ENCOBIO Jr. foi idealizado com base no Encontro de Biologia da UEFS (ENCOBIO), que é voltado para estudantes do ensino superior e que também é construído pelos estudantes do curso.

O projeto, efetivado no ano de 2003 com a criação do Primeiro Encontro de Biologia Júnior da UEFS, teve como tema central: “Ciência e educação: Uma pluralidade de Ideias” e com grande êxito alcançou um público de mais de 300 participantes. No ano de 2004 a segunda edição do Encobio Jr. teve como tema principal: “Ciência do cotidiano: Estimulando a Curiosidade”. Este foi marcado pelo sucesso de sua realização e aumento expressivo do número de participantes em 67% com relação ao ano anterior.

A terceira edição do evento, no ano de 2005, foi a de maior repercussão, chegando a marca de 900 participantes inscritos, alcançando nível estadual, atendendo a diversas cidades do interior da Bahia. Esta teve como tema central: “Homem, Sociedade e Natureza: Desvendando suas relações”. No ano de 2006, o quarto encontro teve como tema central: “Conhecimento Biológico: da Universidade para a Comunidade”, o qual preservou o público a nível estadual, atingindo cerca de 500 participantes.

A quinta edição do Encobio Jr. ocorreu no ano de 2009 e teve como tema central: “Consumo (in) Consciente: uma questão de reflexão”, alcançando novamente o público a nível estadual. A sexta edição do evento tem a proposta de acontecer no ano de 2015, seis anos após a última edição, trazendo o tema “O Vivo dentro do sertão: Valorizando e descobrindo as riquezas do semiárido”, com a proposta de discutir sobre o sertão e suas riquezas biológicas e culturais. E, dessa maneira, promover mais um evento marcado pelo sucesso de sua realização.